Table 4 PCR amplification of Foc races using Foc Lineage VI specific primer
No | Isolate code | Lineage 6 | Race 1 | Race 4 | Identity |
|---|---|---|---|---|---|
1 | SB005 | − | − | − | − |
2 | AP005 |  +  |  +  | − | Race 1 |
3 | AP007 |  +  |  +  | − | Race 1 |
4 | KL004 |  +  |  +  | − | Race 1 |
5 | KB002 |  +  |  +  | − | Race 1 |
6 | NJ001 | − | − | − | − |
7 | CV003 | − | − | − | − |
8 | SB003 | − | − | − | − |
9 | AP003 |  +  |  +  | − | Race 1 |
10 | FH001 |  +  |  +  | − | Race 1 |
11 | KL003 |  +  |  +  | − | Race 1 |
12 | KN001 |  +  |  +  | − | Race 1 |
13 | KL002 |  +  |  +  | − | Race 1 |
14 | AP001 |  +  |  +  | − | Race 1 |
15 | CV005 |  +  |  +  | − | Race 1 |
16 | AP009 |  +  |  +  | − | Race 1 |
17 | EM003 | − | − | − | − |
18 | EM006 | − | − | − | − |
19 | AP006 |  +  |  +  | − | Race 1 |
20 | EM001 |  +  |  +  | − | Race 1 |
21 | AP008 |  +  |  +  | − | Race 1 |
22 | CV001 |  +  |  +  | − | Race 1 |
23 | UK001 |  +  |  +  | − | Race 1 |
24 | AP012 |  +  |  +  | − | Race 1 |
25 | AP004 |  +  |  +  | − | Race 1 |
26 | SB009 |  +  |  +  | − | Race 1 |
27 | CV006 |  +  |  +  | − | Race 1 |
28 | KN005 |  +  |  +  | − | Race 1 |
29 | KN003 | − | − | − | − |
30 | GG001 | − | − | − | − |
31 | SB002 | − | − | − | − |
32 | SB006 | − | − | − | − |
33 | CV004 |  +  |  +  | − | Race 1 |
34 | KL005 |  +  |  +  | − | Race 1 |
35 | CV002 |  +  |  +  | − | Race 1 |
36 | SB001 |  +  |  +  | − | Race 1 |
37 | KL001 |  +  |  +  | − | Race 1 |
38 | KN002 | − | − | − | − |
39 | SB004 | − | − | − | − |
40 | KL007 |  +  |  +  | − | Race 1 |
41 | GN001 |  +  |  +  | − | Race 1 |